Имам фактура за ВОП на стоки от м.03 и последваща фактура за продажба (износ) на същите. Стоките, обаче, ще бъдат прехвърлени през м.04.
Кога трябва да отразя протоколите по чл.117 и изходящата фактура в дневниците по ДДС- през м.03 или през м.04?

В преиода на датата на събитието.

Събитието, т.е. самата доставка на стоките ли?

Виж в ЗДДС, какво е "дата на събитието".

Фактурата е повод да се състави протокол по ВОП.Датата на фактурата прехвърля собствеността за вас. В 15 дневен срок протокол.Вие казвате че стоката ще се прехвърли м.04. имате в предвид че ще се транспортира м. 04. или каква.

Да, стоките ще бъдат транспортирани през м.04.
Ако издам протоколи за ВОП през м.03 и например имам данъчна проверка (ДДС за възстановяване) за ползвания през м.03 ДК, няма да мога да покажа документи за транспорта на стоките и в резултат на това възможно ли е данъчните да сметнат, че не е налице основание за ползване на ДК?