При потвърждаване на салдата в края на годината се останови,че фактура от Германия за месац март 2010 не е дошла до счетоводството.Сега мога ли да издам протокол с дата януари 2011 и да го включа в дневника на покупки и дневника на продажби? Самата фактура ще я осчетоводя с дата 31.12.2010, за да отиде в разход за 2010г.

нямаш вече алтернатива...................и ще ви напишат акт

Виж мисля че беше чл.126 от ЗДДС - коригираща декларация и писмо до НАП с обяснения по въпроса. Ако след корекция се дължи ДДС се плаща само лихвата

Мога ли да включа протоколите в дневниците за покупки и продажби в месец 01.2011 или само в дневника за продажби?

Включете я в двата дневника на декл. за 01.2011 г., при ревизия ще ви начислят лихви.